Se hai configurato l'account con IMAP, è normale -> https://support.mozilla.org/it/kb/differenze-imap-pop3

(ovviamente i messaggi non vengono cancellati dai PC spenti, ma vengono cancellati dal server per cui quando avvii nuovamente il computer o non trova i messaggi da scaricare oppure si sincronizza cancellandoli se già scaricati)

Non ho configurato account IMAP ma POP3 il problema è ovviamente lo stesso è risolvibile?

Con Pop3 non dovrebbe accadere affatto. Però dipende da che impostazioni hai impostato

Quale è la configurazione che devo usare per con POP3 per risolvere il mio problema, se gentilmente me la indica le sarei grato. Cordiali saluti

Mi spiace ma non posso consigliarti una configurazione perché non so come lavora il tuo server, ne come lavorano i client che accedono alla casella di posta ne cosa vuoi ottenere di preciso.

In generale quando si accede da dispositivi diversi ad una stessa casella email è preferibile IMAP a POP. Se vuoi comunque usare POP, assicurati di impostare su tutti i client:

• di lasciare la posta sul server dopo il download
• di non cancellare la posta sul server quando la cancelli dal client

In Thunderbird trovi queste opzioni nella configurazione degli account (Tasto menu > Impostazioni account)